Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP7AQ04656 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms