Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms