Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASIC1P78348 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms