Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVFRD-1P60508 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms