Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF1P55201 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms