Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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