Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms