Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms