Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NFKB1P19838 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms