Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HDCP19113 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDCP19113 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDCP19113 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDCP19113 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDCP19113 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDCP19113 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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