Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF4P18085 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms