Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms