Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms