Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms