Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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