Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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