Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGSF9Q9P2J2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms