Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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