Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms