Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 APOBEC3D-201ENST00000216099 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms