Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms