Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113Q902F9 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms