Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms