Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RNF182Q8N6D2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms