Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLF2Q8IX21 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLF2Q8IX21 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms