Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERC6Q8IVU3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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