Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC142Q17RM4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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