Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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