Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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AP3B2Q13367 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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AP3B2Q13367 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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AP3B2Q13367 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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AP3B2Q13367 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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AP3B2Q13367 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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AP3B2Q13367 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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AP3B2Q13367 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms