Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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