Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms