Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DSC2Q02487 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DSC2Q02487 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms