Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms