Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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