Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDIT3P35638 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms