Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms