Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms