Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms