Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms