Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms