Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYN1P17600 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms