Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTLA4P16410 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms