Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PDCL3P7-201ENST00000392251 712 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LINC02243-201ENST00000441841 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC236972.3-202ENST00000620734 1222 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CLEC4C-205ENST00000542353 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms