Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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