Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GLI3P10071 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GLI3P10071 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GLI3P10071 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GLI3P10071 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GLI3P10071 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GLI3P10071 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI3P10071 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI3P10071 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GLI3P10071 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms