Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms