Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVV-2B6SEH9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVV-2B6SEH9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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