Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms