Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms