Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF22A3QJZ6 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms